绘就全球首张家蚕超级泛基因组图谱 重庆开启家蚕分子育种新纪元

重庆在家蚕基因组研究方面再获重大突破。10月9日，西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕桑产业技术体系首席科学家代方银教授团队发布消息称，该团队已完成家蚕大规模种质资源基因组解析，成功绘就全球首张家蚕超级泛基因组图谱，并率先创建“数字家蚕”基因库，开启家蚕分子育种的新纪元。

代方银表示，超级泛基因组是一个物种所有基因组信息的总和，它比单一参考基因组涵盖更多的遗传多样性。因此，绘就家蚕超级泛基因组图谱，对深化功能基因组研究、种质创新等意义重大。

为了全面反映桑蚕的所有基因组信息，从2019年开始，该研究团队对1078份各类蚕种质资源进行了深度二代测序，并对其中545份代表性资源进行了三代测序，鉴定4300余万个SNP(单核苷酸多态性)、930余万个Indel(插入缺失标记)、340余万个结构变异和7308个新基因(家族)，由此绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱。

“团队完成基因组测序的家蚕材料，涵盖全世界90%以上的家蚕代表性种质资源。”著名蚕遗传育种专家、中国工程院院士向仲怀表示，这些材料含有丰富的表型多样性，包括不同茧丝产量质量、生长发育、抗病抗逆、体型体色等。

因此，“数字家蚕”基因库就像一本完整的参考书。以前，科学家们鉴定家蚕特定性状的基因或研究其因果变异时，犹如“大海捞针”。现在，“数字家蚕”基因库里的超级泛基因组为他们提供了“精细网格化”的“坐标”指导。科学家要揭秘家蚕的特征特性，就像是“查字典”，可以快速、精准地找到负责表型的基因组序列。

业内人士称，家蚕含有大量具有重要经济价值的素材，具有广食性、抗病抗逆、高转化率等特性，应用家蚕超级泛基因组可规模化挖掘家蚕重要经济性状相关序列，对家蚕设计育种具有强力的支撑作用。

据悉，该研究成果的相关论文于今年9月24日在国际名刊《自然通讯》在线发表。论文评审专家认为，该超级泛基因组囊括了目前最全面的家蚕和野桑蚕基因组信息，是迄今为止全球动植物领域最大的长读长泛基因组。(李志峰)

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